Dès qu’il fut possible de recevoir des navires de gros tonnage dans le port, Campeche se spécialisa dans l’exportation du "palo de tinte", un bois utilisé pour la teinture des tissus. Ce commerce assura immédiatement prospérité et célébrité à la ville. Il attira également l’attention des pirates des Caraïbes qui en firent leur cible favorite. Tout au long du 17ème siècle raids et massacres se succédèrent jusqu’à ce qu’en 1686 la couronne d’Espagne décide de la construction de fortifications.