Machu Picchu vit sous le régime d’un climat tropical. La forêt amazonienne et les vents qui tourbillonnent entre les montagnes environnantes apportent pluie (2000mm par an), brume et humidité. Les précipitations sont aussi violentes qu’imprévisibles. Un soleil aveuglant peut être remplacé par un orage diluvien en quelques minutes.