L’arbre le plus courant sur l’île est le kolle. Il est utilisé dans la construction et sert de combustible. Taquile possède aussi une flore remarquable : la cantuta, la fleur nationale du Pérou, le chukjo qu’on utilise comme détergent et la muna qui soigne les maux d’estomac. La coca, elle, fait partie des rares produits importés.