Chaque maison mesure environ 40 mètres carrés, avec une grande pièce carrée contenant un foyer en pierre utilisé pour le chauffage et la cuisine. Compte tenu du nombre de maisons et de leurs dimensions, il semble probable que pas plus d'une cinquantaine de personnes vivaient à Skara Brae en même temps. Le village bénéficiait d'un système de canalisations qui incluait peut-être une forme de toilettes dans chaque logement.