Hongcun a été fondé à l’époque de la dynastie des Song du nord (960 à 1127). Il a ensuite prospéré sous les dynasties Ming (1368-1644) et Qing (1644-1911) comme centre du commerce local. Le village s’organise autour d’un double bassin central, réunion de deux plans d’eau naturels : la mare de la lune et le lac Nanku.