Toniná constitue un exemple unique d’organisation architecturale dans le monde Maya. Ici pas de pyramide. Une seule «Grande Maison de Pierre», une acropole construite sur sept étages, ayant en son intérieur un labyrinthe qui permet de passer d’un niveau à l’autre au travers de couloirs, d’escaliers et de pièces initiatiques dont le rôle n’est pas complètement établi.